当麻不敢相信自己的眼睛，眼前竟然出现了一个像被单一样挂在阳台栏杆上的少女！这个城市虽然是最先进的科学引导的学院都市，但是这种超越现实的情节还是让当麻惊呆了。这位自称为“茵蒂克丝”的少女告诉当麻，她因为拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀。当麻靠着自己的超能力确认了少女的魔法，但是他也想劝告她离开，因为他知道魔法世界中的危险。然而，放学回家的当麻却惊见茵蒂克丝倒在血泊中！在这个交叉的世界里，科学与魔术的冲突让当麻和茵蒂克丝的故事拉开了序幕。g