在未来的某一天，人类的科学家们偶然发现了神秘的“盖塔射线”，但是，这个发现却注定将引发全球性的毁灭性灾难。就在人类沉浸在这个发现的喜悦之中，突如其来的INVADER入侵月球，一夜之间，月球变成了它们的据点。人类负责抵抗的超级机器人在接下来的十年里与INVADER进行了惨烈的战斗，最终成功击败对方。但是，这场胜利的代价是高昂的，伟大的早乙女博士所研发的“三一万能侠”遭到INVADER的猛烈攻击而被摧毁。面对这场惨痛的失败，早乙女博士开始着手开发全新的“新三一万能侠”，并寻找三个驾驶员来掌控这个超级机器人，抵御未来可能面临的挑战和危险。g